Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms