Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf2ird2Q99NI3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf2ird2Q99NI3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf2ird2Q99NI3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf2ird2Q99NI3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf2ird2Q99NI3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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