Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GsdmcQ99NB5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms