Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ms4a8Q99N10 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms