Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RtcbQ99LF4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms