Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99KU6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99KU6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q99KU6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms