Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn2aQ99KJ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn2aQ99KJ0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms