Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbox1Q924Y0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms