Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms