Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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