Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms