Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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