Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms