Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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