Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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