Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sash3Q8K352 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms