Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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