Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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