Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Aph1bQ8C7N7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Aph1bQ8C7N7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Aph1bQ8C7N7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Aph1bQ8C7N7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Aph1bQ8C7N7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aph1bQ8C7N7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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