Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7cQ8C6E1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms