Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8C5C9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms