Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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