Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp38Q8BW70 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp38Q8BW70 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms