Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zfp398Q8BV16 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp398Q8BV16 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp398Q8BV16 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp398Q8BV16 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp398Q8BV16 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms