Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc2Q8BKV1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms