Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Best2Q8BGM5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms