Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q8BGC1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q8BGC1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Q8BGC1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Q8BGC1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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