Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmtc4Q8BG19 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms