Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpped1Q8BFS6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cpped1Q8BFS6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cpped1Q8BFS6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cpped1Q8BFS6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cpped1Q8BFS6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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