Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms