Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms