Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim19Q80ZU4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms