Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms