Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms