Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lamp3Q7TST5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms