Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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