Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcdh8Q7TSK3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms