Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms