Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms