Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl2Q78Y63 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms