Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspg5Q71M36 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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