Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms