Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms