Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms