Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms