Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chd4Q6PDQ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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