Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cachd1Q6PDJ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cachd1Q6PDJ1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cachd1Q6PDJ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cachd1Q6PDJ1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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