Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms