Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms