Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms